Theo đó, gói thầu EPC được thực hiện theo quy trình gồm 07 bước như sau:
Bước 1: Người quyết định đầu tư hoặc người có thẩm quyền tiến hành phê duyệt dự án đầu tư xây dựng, thiết kế FEED.
Bước 2: Chủ đầu tư phê duyệt HSMT/HSYC.
Bước 3: Nhà thầu nộp HSDT/HSĐX.
Bước 4: Chủ đầu tư phê duyệt KQLCNT và ký kết hợp đồng với nhà thầu trúng thầu.
Bước 5: Nhà thầu lập thiết kế kỹ thuật, thiết kế bản vẽ thi công.
Bước 6: Người có thẩm quyền phê duyệt thiết kế kỹ thuật, còn đối với thiết kế bản vẽ thi công sẽ do chủ đầu tư hoặc người có thẩm quyền tiến hành phê duyệt.
Bước 7: Nhà thầu sẽ thực hiện hoặc chọn nhà cung cấp thiết bị, xây dựng.
Thông tư 11/2016/TT-BKHĐT (Có hiệu lực từ ngày 01/10/2016) không hướng dẫn áp dụng đối với trường hợp gói thầu có thể tách thành các gói thầu riêng biệt như thiết kế (E), cung cấp hàng hóa (P) và xây lắp (C).