Theo đó, không thu phí đối với việc sử dụng kết cấu hạ tầng đường sắt phục vụ cho các mục đích sau đây:
- Kiểm tra, sửa chữa, bảo trì kết cấu hạ tầng đường sắt;
- Phục vụ phòng chống lụt bão và cứu hộ, cứu nạn đường sắt;
- Phục vụ nhu cầu quốc phòng và an ninh quốc gia.
Ngoài ra, Thông tư này còn quy định về việc kê khai, nộp phí như sau:
- Mức phí sử dụng kết cấu hạ tầng đường sắt được xác định là 8% trên doanh thu kinh doanh vận tải đường sắt.
- Doanh nghiệp kinh doanh vận tải đường sắt thực hiện kê khai, nộp phí theo tháng, quyết toán năm theo hướng dẫn tại Thông tư 156/2013/TT-BTC .
- Khoản tiền phí sử dụng kết cấu hạ tầng đường sắt phải nộp được hạch toán vào chi phí hợp lý của hoạt động kinh doanh vận tải đường sắt khi xác định thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp.
Thông tư 295/2016/TT-BTC có hiệu lực từ ngày 01/01/2017.