Theo đó, quy trình thanh toán thuế, phí, lệ phí trong trường hợp lập chứng từ trực tiếp tại Cổng TTĐT hải quan như sau:
- TCHQ căn cứ vào thông tin đề nghị của người nộp thuế (NNT), ký số của TCHQ sau đó thực hiện thông báo tới Ngân hàng thương mại (NHTM) được yêu cầu trích chuyển tài khoản.
- NHTM sau khi nhận thông tin sẽ gửi thông báo kết quả đã tiếp nhận yêu cầu của NNT tới Cổng TTĐT hải quan.
- Tiếp đó, NHTM sẽ kiểm tra chữ ký của NNT và TCHQ, ủy quyền trích nợ, số dư tài khoản và gửi thông điệp thông báo kết quả xử lý của NHTM cho NNT.
- Trường hợp nếu yêu cầu trích tài khoản của NNT được NHTM chấp nhận thì NHTM sẽ thực hiện gửi lệnh thanh toán đến Cổng thanh toán điện tử hải quan.
Đặc biệt thông tin về kết quả xử lý của NHTM thì NNT có thể xem trên Cổng TTĐT hải quan.
Xem chi tiết tại quyết định 2596/QĐ-TCHQ có hiệu lực ngày 31/7/2017.