Theo đó, việc phân bổ vốn đầu tư phát triển và kinh phí sự nghiệp cho các địa phương từ NSTW sẽ dựa vào các tiêu chí sau:
- Quy mô dân số và số hộ dân tộc thiểu số;
- Tỷ lệ hộ nghèo và quy mô hộ nghèo;
- Diện tích đất tự nhiên;
- Đơn vị hành chính và huyện có xã biên giới;
Bên cạnh đó, ngoài nguồn vốn hỗ trợ từ NSTW, các địa phương nhận hỗ trợ từ NSTW phải bố trí nguồn vốn đối ứng hằng năm theo tỷ lệ tối thiểu như sau (tính trên tổng NSTW hỗ trợ thực hiện Chương trình):
- Các địa phương đang nhận hỗ trợ từ NSTW từ 70% trở lên: tùy thuộc vào khả năng cân đối NSĐP;
- Các địa phương đang nhận hỗ trợ từ NSTW từ 50% - dưới 70%: tối thiểu bằng 10%;
- Các địa phương đang nhận hỗ trợ từ NSTW dưới 50%: tối thiểu bằng 15%.
Quyết định 48/2016/QĐ-TTg có hiệu lực từ ngày 15/12/2016.