Theo quy định thì căn cứ tính thuế bảo vệ môi trường là số lượng hàng hóa tính thuế và mức thuế tuyệt đối.
Trong đó, mức thuế tuyệt đối làm căn cứ tính thuế bảo vệ môi trường là mức thuế được quy định tại Biểu mức thuế bảo vệ môi trường ban hành kèm theo Nghị quyết 579/2018/UBTVQH14 ngày 26/9/2018.
(Hiện hành đang thực hiện theo Biểu thuế quy định tại Nghị quyết 1269/2011/UBTVQH12 ngày 14/7/2011 và Nghị quyết 888a/2015/UBTVQH13 ngày 10/3/2015).
Thông tư 106/2018/TT-BTC có hiệu lực từ ngày 01/01/2019 và thay thế Thông tư 60/2015/TT-BTC ngày 27/4/2015.
Trong quá trình thực hiện, nếu có vướng mắc đề nghị các tổ chức, cá nhân phản ánh kịp thời về Bộ Tài chính để được nghiên cứu, giải quyết.