Thư ngỏ cập nhật chính sách về hóa đơn điện tử, đăng ký thuế với các Cơ sở giáo dục công lập tại Hà Nội

Thư ngỏ cập nhật chính sách về hóa đơn điện tử, đăng ký thuế với các Cơ sở giáo dục công lập tại Hà Nội (Hình từ văn bản)

Thuế TP Hà Nội đã có Thư ngỏ gửi người nộp thuế về cập nhập chính sách thuế về hóa đơn điện tử, đăng ký thuế, kê khai Quyết toán thuế, dữ liệu kê khai thuế đối với các Cơ sở giáo dục công lập.

Thư ngỏ

Thư ngỏ cập nhật chính sách về hóa đơn điện tử, đăng ký thuế với các Cơ sở giáo dục công lập tại Hà Nội

Thuế TP Hà Nội gửi lời chào trân trọng và cảm ơn sự hợp tác, đồng hành của Qúy Nhà Trường trong việc thực hiện các quy định về thuế trong thời gian qua.

Trong năm 2024, Cục Thuế TP Hà Nội (trước sắp xếp) đã ban hành Công văn 3078/CTHN-TTKT3 về chính sách thuế đối với đơn vị sự nghiệp công lập trong lĩnh vực giáo dục và đào tạo, tổ chức tọa đàm, hướng dẫn, hỗ trợ các đơn vị sự nghiệp giáo dục công lập về chính sách thuế và thực hiện Quyết toán thuế TNDN năm 2023 tại Văn phòng Cục Thuế TP Hà Nội và 30 địa bàn Quận, Huyện, thị xã (trước sắp xếp) trên địa bàn TP Hà Nội.

Căn cứ dữ liệu trên ứng dụng quản lý thuế, Thuế TP Hà Nội thông báo đến Quý nhà trường tình hình kê khai, nộp thuế GTGT, thuế TNDN, báo cáo tài chính từ năm 2017-2024 của Quý nhà trường (dữ liệu chi tiết kèm theo thư ngỏ).

Để đảm bảo thực hiện đúng quy định về thuế, Thuế TP Hà Nội đề nghị NNT rà soát, kiểm tra các tờ khai.

Nếu Quý nhà trường đã nộp tờ khai mà cơ quan thuế chưa nhận được thì phản hồi về cơ quan thuế quản lý trực tiếp.

Qua rà soát, nếu phát hiện sai sót về việc kê khai thuế, đề nghị Quý nhà trường thực hiện kê khai bổ sung, điều chỉnh theo quy định của Luật Quản lý thuế.

Thuế TP Hà Nội lưu ý tới Quý nhà trường một số nội dung sau:

* Về đăng ký phương pháp kê khai thuế

Thuế TP Hà Nội lưu ý các trường chưa đăng ký phương pháp kê khai thuế GTGT, TNDN thì thực hiện khai bổ sung phương pháp kê khai trên mẫu Tờ khai điều chỉnh, bổ sung thông tin đăng ký thuế (Mẫu số 08-MST ban hành kèm theo Thông tư 86/2024/TT-BTC) theo quy định.

* Một số lưu ý khi kê khai thuế GTGT, TNDN, TNCN

- Về kê khai nộp thuế TNDN:

+ Đối tượng chịu thuế TNDN:

Tại điểm d khoản 1 Điều 2, khoản 1 Điều 3 Luật Thuế thu nhập doanh 2025 quy định:

“Điều 2. Người nộp thuế

1. Người nộp thuế thu nhập doanh nghiệp là tổ chức hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có thu nhập chịu thuế theo quy định của Luật này (sau đây gọi là doanh nghiệp), bao gồm:

…d) Đơn vị sự nghiệp được thành lập theo quy định của pháp luật Việt Nam...

Điều 3. Thu nhập chịu thuế

1. Thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp bao gồm thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ và thu nhập khác quy định tại khoản 2 Điều này...”

+ Một số quy định về giá dịch vụ đào tạo như sau:

++ Tại khoản 3 Điều 19 Luật Giá 2012 (hiệu lực từ ngày 01/01/2013) quy định:

“Điều 19. Hàng hóa, dịch vụ do Nhà nước định giá:

…3. Danh mục hàng hóa, dịch vụ do Nhà nước định giá được quy định như sau:

….c) Định khung giá và mức giá cụ thể đối với:

…- Dịch vụ khám bệnh, chữa bệnh và dịch vụ giáo dục, đào tạo tại cơ sở khám

bệnh, chữa bệnh, cơ sở giáo dục, đào tạo của Nhà nước;”

++ Căn cứ khoản 1 Điều 30 Nghị định 60/2021/NĐ-CP quy định cơ chế tự chủ tài chính của đơn vị sự nghiệp công lập:

“1. Nguồn tài chính

- Nguồn từ ngân sách nhà nước cấp kinh phí

- Nguồn từ thu học phí;

- Nguồn thu từ hoạt động sản xuất, kinh doanh dịch vụ khác: Thu từ dịch vụ nội trú, hoạt động SX, NCKH, liên kết đào tạo, cho thuê mặt bằng, bán giáo trình, thu lãi tiền gửi, thanh lý tài sản …”

++ Căn cứ khoản 1 Điều 3 Nghị định 81/2021/NĐ-CP quy định: 

“ 1. Giá dịch vụ trong lĩnh vực giáo dục, đào tạo là số tiền người sử dụng dịch vụ phải trả cho từng dịch vụ trong lĩnh vực giáo dục, đào tạo và giáo dục nghề nghiệp, bao gồm: học phí (theo các cấp học và trình độ đào tạo) và giá các dịch vụ khác trong lĩnh vực giáo dục, đào tạo …”

++ Căn cứ Điều 99 Luật Giáo dục 2019 quy định: 

“Học phí là khoản tiền người học phải nộp để chi trả một phần hoặc toàn bộ chi phí của dịch vụ giáo dục, đào tạo”

Căn cứ các quy định trên, giá dịch vụ trong lĩnh vực giáo dục, đào tạo (bao gồm học phí chính quy) thuộc đối tượng điều chỉnh của Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp và các văn bản hướng dẫn thi hành.

+ Phương pháp kê khai thuế TNDN và hồ sơ khai thuế:

Có 2 phương pháp kê khai thuế TNDN như sau:

(1) Kê khai theo phương pháp doanh thu – chi phí:

++ Áp dụng đối với đơn vị xác định được doanh thu, chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh.

++ Mẫu Tờ khai: Kê khai theo Mẫu số 03/TNDN

(2) Kê khai theo phương pháp tỷ lệ % trên doanh thu bán hàng hóa, dịch vụ:

++ Áp dụng đối với đơn vị xác định được doanh thu nhưng không xác định được chi phí, thu nhập của hoạt động kinh doanh.

+++ Đối với dịch vụ (bao gồm cả lãi tiền gửi, lãi tiền cho vay): 5%.

+++ Riêng hoạt động giáo dục, y tế, biểu diễn nghệ thuật: 2%.

++ Mẫu Tờ khai: Kê khai theo Mẫu số 04/TNDN.

(3) Về hồ sơ khai thuế:

Tại khoản 2 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP quy định:

“2. Hồ sơ khai thuế tương ứng với từng loại thuế, người nộp thuế, phù hợp với phương pháp tính thuế, kỳ tính thuế (tháng, quý, năm, từng lần phát sinh hoặc quyết toán). Trường hợp cùng một loại thuế mà người nộp thuế có nhiều hoạt động kinh doanh thì thực hiện khai chung trên một hồ sơ khai thuế...”

Căn cứ quy định nêu trên, các khoản thu của các trường (học phí chính quy, liên doanh liên kết, các dịch vụ khác…) phải thực hiện khai chung trên một hồ sơ khai thuế với cùng một phương pháp kê khai thuế.

- Về kê khai thuế GTGT

Căn cứ khoản 3 Điều 7 Nghị định 126/2020/NĐ-CP quy định: Người nộp thuế không phải nộp hồ sơ khai thuế trong trường hợp chỉ có hoạt động kinh doanh thuộc đối tượng không chịu thuế theo quy định của pháp luật về thuế đối với từng loại thuế.

Như vậy, nếu cơ sở giáo dục chỉ có khoản thu thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT như thu từ học phí đào tạo thì đơn vị thuộc đối tượng không phải kê khai, nộp thuế GTGT.

Tuy nhiên trên thực tế các trường có thể có nhiều các khoản thu khác nhau, trong đó có các khoản thu thuộc đối tượng chịu thuế GTGT. Do đó đề nghị các trường lưu ý:

Trong trường hợp ngoài khoản thu từ học phí, nếu đơn vị phát sinh các khoản thu khác chịu thuế GTGT thì đơn vị vẫn phải kê khai thuế GTGT. Trong đó khoản thu từ học phí được kê khai vào chỉ tiêu doanh thu không chịu thuế trên Tờ khai thuế GTGT.

* Về việc sử dụng hóa đơn điện tử:

- Các cơ sở giáo dục thực hiện lập, quản lý, sử dụng hóa đơn điện tử theo quy định tại Nghị định 123/2020/NĐ-CP; Nghị định 70/2025/NĐ-CP; Thông tư 32/2025/TT-BTC.

- Cơ sở giáo dục đào tạo có trách nhiệm xuất hóa đơn điện tử cho học sinh, sinh viên tương ứng với mỗi lần thu học phí.

- Thời điểm xuất hóa đơn thu học phí là thời điểm hoàn thành việc cung cấp dịch vụ giáo dục. Trường hợp người cung cấp dịch vụ có thu tiền trước hoặc trong khi cung cấp dịch vụ thì thời điểm lập hóa đơn là thời điểm thu tiền. Học sinh sinh viên thường đóng học phí vào đầu năm học hoặc đầu học kỳ thì thời điểm xuất hóa đơn thu học phí là thời điểm thu tiền (Điều 1 Nghị định 70/2025/NĐ-CP).

- Trường hợp vi phạm hành chính về thuế và hóa đơn thì bị xử phạt theo quy định tại Nghị định 125/2020/NĐ-CP và Nghị định 102/2021/NĐ-CP.

* Một số văn bản có liên quan:

- Thông báo 551/TB-VPCP ngày 28/11/2017:“1. Thuế đối với đơn vị sự nghiệp công lập thực hiện đúng quy định của pháp luật thuế”.

- Công văn 11391/BTC-TCT ngày 18/9/2020 của Bộ Tài chính gửi Kiểm toán nhà nước, Bộ Giáo dục và Đào tạo về chính sách thuế TNDN;

- Công văn 13387/BTC-CST ngày 04/12/2023 của Bộ Tài chính gửi Học viện Nông nghiệp Việt Nam về chính sách thuế TNDN đối với học phí tại các cơ sở giáo dục đại học công lập

- Công văn 3078/CTHN-TTKT3 ngày 16/01/2024 về việc chính sách thuế đối với đơn vị sự nghiệp công lập trong lĩnh vực giáo dục và đào tạo;

- Công văn 2346/CT-CS ngày 09/7/2025 của Cục Thuế trả lời vướng mắc về chính sách thuế đối với cơ sở giáo dục công lập.

Đề nghị các đơn vị sự nghiệp công lập trong lĩnh vực giáo dục và đào tạo thực hiện kê khai, xác định nghĩa vụ thuế đúng theo các văn bản quy định pháp luật và đúng thời hạn theo quy định. Trong quá trình thực hiện nếu có vướng mắc đề nghị người nộp thuế liên hệ với cơ quan thuế quản lý trực tiếp để được hướng dẫn và hỗ trợ.