Công văn 5388: Cục Thuế trả lời vướng mắc về chính sách thuế

Công văn 5388: Cục Thuế trả lời vướng mắc về chính sách thuế (Hình từ Internet)

Ngày 20/11/2025, Cục Thuế ban hành Công văn 5388/CT-CS về việc chính sách thuế.

Công văn 5388/CT-CS

Công văn 5388: Cục Thuế trả lời vướng mắc về chính sách thuế

Theo đó, Cục Thuế nhận được Công văn 1010/PTH-KTr2 ngày 04/9/2025 của Thuế tỉnh Phú Thọ về chính sách thuế. Về vấn đề này, Cục Thuế có ý kiến như sau:

(1) Về việc xử lý thu hồi hoàn thuế

- Căn cứ khoản 11 Điều 16, khoản 3 Điều 47, khoản 1 Điều 59 và Điều 112 Luật Quản lý thuế 2019 ngày 13/6/2019 quy định về quyền của người nộp thuế, khai bổ sung hồ sơ khai thuế; xử lý đối với việc chậm nộp tiền thuế; nhiệm vụ, quyền hạn của thủ trưởng cơ quan quản lý thuế ra quyết định.

- Căn cứ khoản 6 Điều 6 và Điều 10 Luật số 56/2024/QH15 ngày 29/11/2024 sửa đổi, bổ sung, bãi bỏ một số khoản của Điều 47 Luật Quản lý thuế và hiệu lực thi hành.

- Căn cứ Điều 40 Thông tư 80/2021/TT-BTC ngày 29/9/2021 của Bộ Tài chính hướng dẫn một số điều của Luật Quản lý thuế hướng dẫn thu hồi hoàn thuế.

“Điều 40. Thu hồi hoàn thuế

1. Trường hợp cơ quan thuế, cơ quan nhà nước có thẩm quyền qua thanh tra, kiểm tra phát hiện người nộp thuế đã được hoàn không đúng quy định thì người nộp thuế phải nộp số tiền đã được hoàn thừa và nộp tiền chậm nộp tương ứng theo quy định tại Điều 59 Luật Quản lý thuế và Điều 21 Thông tư này vào ngân sách nhà nước kể từ ngày được Kho bạc Nhà nước chi trả tiền hoàn hoặc ngày Kho bạc Nhà nước hạch toán bù trừ tiền hoàn thuế với khoản thu ngân sách nhà nước theo Quyết định về việc thu hồi hoàn thuế theo mẫu số 03/QĐ-THH ban hành kèm theo phụ lục I Thông tư này của cơ quan thuế, Quyết định hoặc Văn bản của cơ quan nhà nước có thẩm quyền.

2. Người nộp thuế tự phát hiện đã được hoàn không đúng quy định thì phải thực hiện khai bổ sung theo quy định tại Điều 47 Luật Quản lý thuế và Điều 7 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP; đồng thời nộp số tiền đã được hoàn thừa và nộp tiền chậm nộp tương ứng theo quy định tại Điều 59 Luật Quản lý thuế và Điều 21 Thông tư này vào ngân sách nhà nước kể từ ngày được Kho bạc Nhà nước chi trả tiền hoàn hoặc ngày Kho bạc Nhà nước hạch toán bù trừ tiền hoàn thuế với khoản thu ngân sách nhà nước.

3. Trường hợp người nộp thuế đã được hoàn thuế giá trị gia tăng đối với hàng hóa xuất khẩu nhưng bị người bán trả lại hàng hóa đã xuất khẩu thì người nộp thuế phải thực hiện khai bổ sung theo quy định tại Điều 47 Luật Quản lý thuế và Điều 7 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP; đồng thời nộp số tiền đã được hoàn tương ứng với hàng xuất khẩu bị trả lại và nộp tiền chậm nộp tương ứng theo quy định tại Điều 59 Luật Quản lý thuế và Điều 21 Thông tư này vào ngân sách nhà nước kể từ ngày được Kho bạc Nhà nước chi trả tiền hoàn hoặc ngày Kho bạc Nhà nước hạch toán bù trừ tiền hoàn thuế với khoản thu ngân sách nhà nước.

4. Người nộp thuế được khai khấu trừ bổ sung số tiền đã được hoàn không đúng quy định nhưng vẫn đáp ứng đủ điều kiện khấu trừ về thuế giá trị gia tăng theo quy định của pháp luật về thuế giá trị gia tăng kể từ kỳ tính thuế tiếp theo kỳ phát hiện sai sót đối với trường hợp quy định tại khoản 2 Điều này hoặc khai vào hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế nhận được Quyết định về việc thu hồi hoàn thuế của cơ quan thuế hoặc Quyết định, Văn bản của cơ quan nhà nước có thẩm quyền đối với trường hợp quy định tại khoản 1 Điều này.”

- Căn cứ quy định trên, đề nghị Thuế tỉnh Phú Thọ căn cứ trên cơ sở hồ sơ, tài liệu thực tế của doanh nghiệp để xử lý thu hồi hoàn đúng quy định của pháp luật.

(2) Về việc xử phạt vi phạm hành chính và tính tiền chậm nộp

Đề nghị Thuế tỉnh Phú Thọ rà soát các văn bản của cơ quan thuế hướng dẫn cụ thể việc kê khai, nộp thuế GTGT của Công ty TNHH BHFLEX VINA và Công ty TNHH YoungPoong Electronics Vina đối với hoạt động thuê doanh nghiệp chế xuất gia công để có cơ sở xem xét việc áp dụng quy định tại khoản 2 Điều 9 Nghị định 125/2020/NĐ-CP ngày 19/10/2020 của Chính phủ.